Wirusy: klasyfikacja wirusów (adansonial i nomenklatura)
Wirusy: Klasyfikacja wirusów!
Istnieją dwa ogólne sposoby klasyfikacji wirusów. Jednym z nich jest klasyczny monotetyczny system hierarchiczny zastosowany przez Linnaeusa dla roślin i zwierząt. Jest to system logiczny, w którym tworzone są podziały co do względnego znaczenia różnych właściwości, które są następnie używane do umieszczenia taksonu w szczególnym rodzaju, porządku, rodzinie, rodzaju itp. Alternatywny system został zaproponowany przez Adansona (1763).
Zdjęcie dzięki uprzejmości: guardianlv.com/wp-content/uploads/2013/11/cholera-virus-or-bacteria-nhbn3b8t.jpg
Zasugerował, że należy wykorzystać wszystkie znane informacje i że wszystkie postacie należy uznać za równie ważne. Istnieją obecnie propozycje i zwolennicy obu tych podejść do klasyfikacji wirusów (Lwoff 1967, Gibbs i Harrison, 1968).
Lwoff i wsp. (1962) zaproponowali układ, w którym rodzaj kwasu nukleinowego w cząsteczce (DNA lub RNA) oznacza architekturę i symetrię cząstek wirusa, obecność lub brak otoczki, liczbę podjednostek morfologicznych (wirusy woskozrne ) lub średnicę wirusów w kształcie prętów uznawano za najbardziej kompetentne znaki (w porządku malejącym) w dokonywaniu większych poddziałów. Ich system był wspierany w propozycjach i zaleceniach Tymczasowego Komitetu ds. Nomenklatury różnych ugrupowań aż do poziomu rodzinnego w pierwszych trzech grupach.
Gromada | Podrzędne | Klasa |
Vira | Deoxyvira | Deoxyhelica |
Deoxycubica | ||
Deoxybinala | ||
Ribovira | Ribohelica | |
Ribocubica |
Klasyfikacja wirusów
1. Klasyfikacja adansonialna:
Adanson (1763), uznał, że najlepsze taksony zostały uzyskane poprzez uwzględnienie wszystkich dostępnych znaków i przypisanie ich równej wagi. Metoda jest pracochłonna i do niedawna nie była używana. Dostępność komputera ponownie zainteresowała tego typu klasyfikacją.
2. Nazewnictwo:
Jednym z głównych powodów, dla których łaciński dwumianowy system nomenklatury dla wirusów jest obecnie nieodpowiedni, jest to, że takie nazwy próbują dostarczyć zarówno etykietę, jak i informacje o tym, że wirus jest oznakowany. Na obecnym etapie wiedzy lub jej braku dla większości wirusów, takie nazwy będą wymagały częstych zmian w przyszłości.
Próbując przezwyciężyć ten problem, Gibbs i jego współpracownicy (Gibbs i in., 1966, Gibbs i Harrison, 1968) zaproponowali dwuczęściowy system, w którym pierwsza część nazwy wirusa jest niezmienną etykietą (obecna nazwa lokalna) i drugi to skodyfikowany magazyn informacji, który można łatwo przyjąć i zmienić, gdy fakty gromadzą się na temat wirusów. Każdy wirus składa się z czterech par symboli w następujący sposób:
Pierwsza para - Rodzaj kwasu nukleinowego / Skórka kwasu nukleinowego.
Druga para - Masa cząsteczkowa kwasu nukleinowego / Procent kwasu nukleinowego w cząstce infekcyjnej.
Trzecia para - zarys cząstek / kontur kapsydu nukleotydowego.
Czwarta para - Rodzaje zainfekowanych hostów / Rodzaje wektora.
Na przykład wirus mozaiki tytoniu (R / 1: 2/5: E / E: S *)